Package: seqan-raptor (3.0.1+ds-2) [debports]

Links for seqan-raptor

Debian Resources:

Bug Reports

Download Source Package :

Not found

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

Præfilter til at forespørge meget store samlinger af nukleotidsekvenser

Raptor er et system for omtrentligt at søge i mange forespørgsler som f.eks næstegenerations sekventeringslæsninger eller transskriptioner i store samlinger af nukleotidsekvenser. Raptor bruger winnowing-minimeringsprogrammer til at definere et sæt af repræsentative k-mer'er, en forlængelse af de indflettede Bloom-filtre (IBF'er) som en fastsat medlemsdatastruktur og sandsynlighedstærskelværdi for minimeringsprogrammer. Denne fremgangsmåde tillader komprimering og partitionering af IBF'en for at aktivere effektiv brug af sekundær hukommelse.

Other Packages Related to seqan-raptor

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbz2-1.0

højkvalitets bloksorteringsfilpakningsbibliotek - kørselstid
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.3)

GCC støttebibliotek
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU Standard C++ bibliotek v3
dep: libxxhash0 (>= 0.6.5)

Delt bibliotek for xxhash
dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0)

YAML-fortolker og udsender for C++
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Komprimeringsbibliotek - kørselstid

sug: cwl-runner

virtual package provided by cwltool, toil

Download seqan-raptor

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	473.3 kB	2,111.0 kB	[list of files]