Пакунок: seqan-raptor (3.0.1+ds-2) [debports]
Links for seqan-raptor
Debian Resources:
Download Source Package :
Не знайденоMaintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
Raptor is a system for approximately searching many queries such as next-generation sequencing reads or transcripts in large collections of nucleotide sequences. Raptor uses winnowing minimizers to define a set of representative k-mers, an extension of the interleaved Bloom filters (IBFs) as a set membership data structure and probabilistic thresholding for minimizers. This approach allows compression and partitioning of the IBF to enable the effective use of secondary memory.
Інші пакунки пов'язані з seqan-raptor
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- Стискання файлів за алгоритмом Барроуза-Уїлера — виконавчий модуль
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.3)
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Підтримувальна бібліотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
-
- dep: libxxhash0 (>= 0.6.5)
- shared library for xxhash
-
- dep: libyaml-cpp0.7 (>= 0.7.0)
- YAML parser and emitter for C++
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)
-
- sug: cwl-runner
- virtual package provided by cwltool, toil
Завантажити seqan-raptor
Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
---|---|---|---|
sparc64 (unofficial port) | 473.3 kB | 2,111.0 kB | [список файлів] |