[ Source: tiddit ]
Package: tiddit (2.12.0+dfsg-3 and others)
Links for tiddit
Debian Resources:
Download Source Package tiddit:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Strukturel variant-kald
TIDDIT er et værktøj brugt til at identificere kromosomale omlægninger ved hjælp af Mate Pair- eller Paired End-sekventeringsdata. TIDDIT identificerer intra- og inter-kromosomale translokationer, sletninger, tandem-duplikationer og inversioner ved hjælp af supplerende justeringer samt uoverensstemmende par.
TIDDIT har to analysemoduler. Sv-tilstanden, som bruges til at søge efter strukturelle varianter. Og cov-tilstand, der analyserer læsedybden af en bam-fil og opretter en dækningsrapport.
Other Packages Related to tiddit
|
|
|
|
-
- dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)
- Dynamisk bibliotek til at manipulere BAM-filer (genomsammenligning)
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armhf]
- GNU Standard C++ bibliotek v3
- dep: libstdc++6 (>= 9) [not armhf]
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
- dep: python3 (<< 3.10)
- dep: python3 (>= 3.9~)
Download tiddit
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.12.0+dfsg-3+b1 | 245.1 kB | 1,040.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 2.12.0+dfsg-3+b1 | 206.7 kB | 835.0 kB | [list of files] |
| armhf | 2.12.0+dfsg-3+b1 | 213.0 kB | 578.0 kB | [list of files] |
| i386 | 2.12.0+dfsg-3+b1 | 239.5 kB | 1,019.0 kB | [list of files] |