Package: libvcflib-tools (1.0.2+dfsg-2)

Links for libvcflib-tools

Debian Resources:

Download Source Package libvcflib:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer - værktøjer

Variant Call Format (VCF) er en flad fil, indryk afgrænser tekstformatet, lavet til præcist at beskrive referenceindekserede variationer mellem individer. VCF tilbyder et fælles udvekslingsformat for beskrivelsen af variation i individer og befolkninger, og har nogle standardformater til rapportering for en bred vifte af registreringsprogrammer til genvarianter.

Vcflib tilbyder metoder til at manipulere og fortolke sekvensvariation som det er beskrevet af VCF. Det er både:

 * en API til at fortolke og arbejde på poster med genvariation, som
   det kan beskrives af VCF-formatet
 * og en samling af kommandolinjeredskaber for afvikling af komplekse
   manipuleringer på VCF-filer.

Denne pakke indeholder flere værktøjer, der bruger biblioteket.

Other Packages Related to libvcflib-tools

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

Bibliotek for entropimåling af bytestrømme
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f+dfsg-5~) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]

Bibliotek for indeksering og sekvensudtrækning fra FASTA-filer - bibliotek

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [not amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not armel, armhf, ppc64el]

GCC støttebibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

Bestem lignende regioner mellem to strenge eller genomsekvenser - bibliotek
dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf]

GNU Standard C++ bibliotek v3

dep: libstdc++6 (>= 9) [not armel, armhf]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0)

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libvcflib1 (>= 1.0.2+dfsg)

C++-bibliotek til at fortolke og manipulere VCF-filer
dep: python3

Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
dep: r-base-core

GNU R-kerne af statistisk beregning og grafiksystem
dep: r-cran-ggplot2

Implementering af Grammar of Graphics
dep: r-cran-gridbase

GNU R-integration af base- og gittergrafik
dep: r-cran-plyr

tools for splitting, applying and combining data

sug: r-cran-pracma

practical numerical math functions for GNU R

Download libvcflib-tools

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	703.5 kB	4,707.0 kB	[list of files]
arm64	641.8 kB	4,099.0 kB	[list of files]
armel	604.0 kB	3,654.0 kB	[list of files]
armhf	624.0 kB	2,950.0 kB	[list of files]
i386	741.8 kB	4,758.0 kB	[list of files]
mips64el	633.4 kB	4,721.0 kB	[list of files]
mipsel	639.3 kB	4,453.0 kB	[list of files]
ppc64el	703.5 kB	7,435.0 kB	[list of files]
s390x	647.7 kB	4,471.0 kB	[list of files]