Пакет: maffilter (1.3.1+dfsg-6)

Връзки за maffilter

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник maffilter.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [jydu.github.io]

Подобни пакети:

process genome alignment in the Multiple Alignment Format

MafFilter applies a series of "filters" to a MAF file, in order to clean it, extract data and computer statistics while keeping track of the associated meta-data such as genome coordinates and quality scores.

 * It can process the alignment to remove low-quality / ambiguous /
   masked regions.
 * It can export data into a single or multiple alignment file in
   format such as Fasta or Clustal.
 * It can read annotation data in GFF or GTF format, and extract the
   corresponding alignment.
 * It can perform sliding windows calculations.
 * It can reconstruct phylogeny/genealogy along the genome alignment.
 * It can compute population genetics statistics, such as site
   frequency spectrum, number of fixed/polymorphic sites, etc.

Други пакети, свързани с maffilter

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0+ds1) [x32]

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0) [не x32]

Boost.Iostreams Library
dep: libbpp-core4t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Core library
dep: libbpp-phyl-omics3t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Phylogenetics library: genomics components
dep: libbpp-phyl12t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Phylogenetic library
dep: libbpp-seq-omics3t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Sequence library: genomics components
dep: libbpp-seq12t64 (>= 2.4.1)

Bio++ Sequence library
dep: libbz2-1.0 [sparc64]

high-quality block-sorting file compressor library - runtime
dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC support library
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [не alpha]

GNU Standard C++ Library v3

dep: libstdc++6 (>= 14-20240221-2.1) [alpha]
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

compression library - runtime

sug: maffilter-examples

process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)

Изтегляне на maffilter

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	240,8 кБ	1 373,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	259,5 кБ	1 308,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	237,9 кБ	1 368,0 кБ	[списък на файловете]
armel	222,9 кБ	1 179,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	228,8 кБ	1 039,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	248,4 кБ	1 250,0 кБ	[списък на файловете]
i386	266,2 кБ	1 271,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	273,0 кБ	1 911,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	248,5 кБ	1 255,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	225,2 кБ	1 489,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	256,3 кБ	1 560,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	254,5 кБ	1 432,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	248,2 кБ	1 176,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	247,8 кБ	1 320,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	284,3 кБ	1 304,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	220,7 кБ	1 503,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	258,5 кБ	1 251,0 кБ	[списък на файловете]