всички настройки
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ] [  experimental  ]
[ Източник:  ]

Пакет: ngmlr (0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2) [debports]

Връзки за ngmlr

Screenshot

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник .

Няма съвпадения

Отговорници:

Външни препратки:

Подобни пакети:

CoNvex Gap-cost alignMents for Long Reads

Ngmlr is a long-read mapper designed to sensitively align PacBilo or Oxford Nanopore to (large) reference genomes. It was designed to quickly and correctly align the reads, including those spanning (complex) structural variations. Ngmlr uses an SV aware k-mer search to find approximate mapping locations for a read and then a banded Smith- Waterman alignment algorithm to compute the final alignment. Ngmlr uses a convex gap cost model that penalizes gap extensions for longer gaps less than for shorter ones to compute precise alignments.

Други пакети, свързани с ngmlr

  • зависимости
  • препоръчани
  • предложени
  • enhances

Изтегляне на ngmlr

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура Големина на пакета Големина след инсталиране Файлове
alpha (неофициална архитектура) 671,9 кБ1 238,0 кБ [списък на файловете]