[ buster ]
[ Източник: tophat ]
Пакет: tophat (2.1.1+dfsg1-2 и други)
Връзки за tophat
Ресурси за Debian:
- Доклади за грешки
- Developer Information
- Журнал на промените в Debian
- Авторски права
- Управление на кръпките в Debian
Изтегляне на пакет-източник tophat.
Отговорници:
- Debian Med Packaging Team (Страница за QA, Пощенски архив)
- Carlos Borroto (Страница за QA)
- Alexandre Mestiashvili (Страница за QA)
- Andreas Tille (Страница за QA)
Външни препратки:
- Начална страница [ccb.jhu.edu]
Подобни пакети:
fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
TopHat aligns RNA-Seq reads to mammalian-sized genomes using the ultra high-throughput short read aligner Bowtie, and then analyzes the mapping results to identify splice junctions between exons. TopHat is a collaborative effort between the University of Maryland Center for Bioinformatics and Computational Biology and the University of California, Berkeley Departments of Mathematics and Molecular and Cell Biology.
Други пакети, свързани с tophat
|
|
|
|
-
- dep: libboost-system1.67.0
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
-
- dep: libboost-thread1.67.0
- portable C++ multi-threading
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC support library
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU Standard C++ Library v3
-
- dep: python
- interactive high-level object-oriented language (Python2 version)
-
- dep: samtools (>= 1.5)
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- compression library - runtime
-
- sug: cufflinks
- Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
Изтегляне на tophat
| Архитектура | Версия | Големина на пакета | Големина след инсталиране | Файлове |
|---|---|---|---|---|
| arm64 | 2.1.1+dfsg1-2+b1 | 591,7 кБ | 3 567,0 кБ | [списък на файловете] |