[ buster ]
[ Источник: tophat ]
Пакет: tophat (2.1.1+dfsg1-2 и другие)
Ссылки для tophat
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код tophat:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Carlos Borroto (Страница КК)
- Alexandre Mestiashvili (Страница КК)
- Andreas Tille (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [ccb.jhu.edu]
Подобные пакеты:
fast splice junction mapper for RNA-Seq reads
TopHat aligns RNA-Seq reads to mammalian-sized genomes using the ultra high-throughput short read aligner Bowtie, and then analyzes the mapping results to identify splice junctions between exons. TopHat is a collaborative effort between the University of Maryland Center for Bioinformatics and Computational Biology and the University of California, Berkeley Departments of Mathematics and Molecular and Cell Biology.
Другие пакеты, относящиеся к tophat
|
|
|
|
-
- dep: libboost-system1.67.0
- Operating system (e.g. diagnostics support) library
-
- dep: libboost-thread1.67.0
- portable C++ multi-threading
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: python
- интерактивный объектно-ориентированный язык высокого уровня (ветка 2.x)
-
- dep: samtools (>= 1.5)
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- библиотека сжатия
-
- sug: cufflinks
- Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
Загрузка tophat
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| arm64 | 2.1.1+dfsg1-2+b1 | 591,7 Кб | 3 567,0 Кб | [список файлов] |