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套件:ggd-utils(1.0.0+ds-1 以及其他的)

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Debian 的資源:

下載原始碼套件 ggd-utils

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相似套件:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

其他與 ggd-utils 有關的套件

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下載 ggd-utils

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構 版本 套件大小 安裝後大小 檔案
alpha (非官方移植版) 1.0.0+ds-1+b9 190。5 kB759。0 kB [檔案列表]
amd64 1.0.0+ds-1+b9 1,842。4 kB5,300。0 kB [檔案列表]
arm64 1.0.0+ds-1+b9 1,592。7 kB5,036。0 kB [檔案列表]
armel 1.0.0+ds-1+b9 1,574。9 kB5,179。0 kB [檔案列表]
armhf 1.0.0+ds-1+b9 1,568。2 kB5,155。0 kB [檔案列表]
i386 1.0.0+ds-1+b9 1,700。6 kB5,195。0 kB [檔案列表]
mips64el 1.0.0+ds-1+b9 1,439。4 kB5,823。0 kB [檔案列表]
ppc64 (非官方移植版) 1.0.0+ds-1+b9 219。6 kB1,088。0 kB [檔案列表]
ppc64el 1.0.0+ds-1+b9 1,584。2 kB5,163。0 kB [檔案列表]
riscv64 (非官方移植版) 1.0.0+ds-1+b6 1,529。0 kB4,886。0 kB [檔案列表]
s390x 1.0.0+ds-1+b9 1,685。1 kB5,556。0 kB [檔案列表]
sparc64 (非官方移植版) 1.0.0+ds-1+b8 187。8 kB1,274。0 kB [檔案列表]
x32 (非官方移植版) 1.0.0+ds-1+b9 199。3 kB716。0 kB [檔案列表]