Paketti: ggd-utils (1.0.0+ds-1 ja muut)

Links for ggd-utils

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti ggd-utils:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Muut pakettiin ggd-utils liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ei alpha, loong64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ppc64, x32]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sparc64]
dep: libgo22 [alpha, ppc64, sparc64, x32]

Runtime library for GNU Go applications

Imuroi ggd-utils

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.0.0+ds-1+b9	190.5 kt	759.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.0.0+ds-1+b17	2,207.2 kt	6,605.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.0.0+ds-1+b17	1,894.2 kt	6,162.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.0.0+ds-1+b17	1,965.2 kt	6,504.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.0.0+ds-1+b17	1,958.3 kt	6,504.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.0.0+ds-1+b17	2,126.7 kt	6,428.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+ds-1+b5	1,790.6 kt	6,011.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.0.0+ds-1+b17	1,791.6 kt	7,204.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+ds-1+b9	219.6 kt	1,088.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.0.0+ds-1+b17	1,889.4 kt	6,417.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.0.0+ds-1+b12	1,963.4 kt	6,225.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.0.0+ds-1+b17	2,006.4 kt	6,865.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.0.0+ds-1+b8	187.8 kt	1,274.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.0.0+ds-1+b9	199.3 kt	716.0 kt	[tiedostoluettelo]