Пакунок: megadepth (1.2.0-4)

Links for megadepth

Debian Resources:

Download Source Package megadepth:

Maintainers:

External Resources:

Homepage [github.com]

Similar packages:

computes coverage from BigWig and BAM sequencing files

A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.

This package is a successor of the program 'bamcount'.

Інші пакунки пов'язані з megadepth

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libbigwig0 (>= 0.4.6+dfsg)

C library for handling bigWig files
dep: libc6 (>= 2.17)

Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Допоміжна бібліотека GCC
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 11)

Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

sug: r-bioc-megadepth

BioCOnductor BigWig and BAM related utilities

Завантажити megadepth

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
ppc64el	81.5 kB	338.0 kB	[список файлів]