[ Quellcode: megadepth ]
Paket: megadepth (1.2.0-4)
Links für megadepth
Debian-Ressourcen:
Quellcode-Paket megadepth herunterladen:
Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
A major concern for the interpretation of DNA and RNA (!) sequencing is the number of reads that cover a particular area. This package has interesting statistics for the distinction of coding and non-coding parts of the genome and knows how to interpret transcripts that span multiple exons.
This package is a successor of the program 'bamcount'.
Andere Pakete mit Bezug zu megadepth
|
|
|
|
-
- dep: libbigwig0 (>= 0.4.6+dfsg)
- C library for handling bigWig files
-
- dep: libc6 (>= 2.17)
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libhts3 (>= 1.10)
- C-Bibliothek für Hochdurchsatz-Sequenzierungsdatenformate
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
-
- sug: r-bioc-megadepth
- BioCOnductor BigWig and BAM related utilities
megadepth herunterladen
| Architektur | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
|---|---|---|---|
| ppc64el | 81,5 kB | 338,0 kB | [Liste der Dateien] |