tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: alien-hunter  ]

Paket: alien-hunter (1.7-10)

alien-hunter için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

alien-hunter Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

Interpolated Variable Order Motifs to identify horizontally acquired DNA

Alien_hunter is an application for the prediction of putative Horizontal Gene Transfer (HGT) events with the implementation of Interpolated Variable Order Motifs (IVOMs). An IVOM approach exploits compositional biases using variable order motif distributions and captures more reliably the local composition of a sequence compared to fixed-order methods. Optionally the predictions can be parsed into a 2-state 2nd order Hidden Markov Model (HMM), in a change-point detection framework, to optimize the localization of the boundaries of the predicted regions. The predictions (embl format) can be automatically loaded into Artemis genome viewer freely available at: http://www.sanger.ac.uk/Software/Artemis/.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Yapısal Biyoloji, Geliştirildiği dil: implemented-in::java, implemented-in::perl, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, Rol: role::program, scope::utility, Amaç: Analiz

alien-hunter ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

alien-hunter indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
all 27,8 kB113,0 kB [dosya listesi]