tüm seçenekler
buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Kaynak: roary  ]

Paket: roary (3.12.0+dfsg-2)

roary için bağlantılar

Screenshot

Debian Kaynakları:

roary Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Benzer paketler:

high speed stand alone pan genome pipeline

Roary is a high speed stand alone pan genome pipeline, which takes annotated assemblies in GFF3 format (as produced, for instance, by Prokka) and calculates the pan genome. Using a standard desktop PC, it can analyse datasets with thousands of samples, something which is computationally infeasible with existing methods, without compromising the quality of the results. 128 samples can be analysed in under 1 hour using 1 GB of RAM and a single processor. To perform this analysis using existing methods would take weeks and hundreds of GB of RAM. Roary is not intended for meta-genomics or for comparing extremely diverse sets of genomes.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::perl, interface::commandline, Rol: Program, Kapsam: Yardımcı Araç, Amaç: use::analysing, use::comparing

roary ile İlgili Diğer Paketler

  • bağımlılıklar
  • tavsiye edilen
  • önerilen
  • enhances

roary indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari Paket Boyutu Kurulu Boyut Dosyalar
all 171,7 kB659,0 kB [dosya listesi]