Paket: maq (0.7.1-9)

maq için bağlantılar

Debian Kaynakları:

maq Kaynak Paketini İndir:

Geliştiriciler:

Dış Kaynaklar:

Ana Sayfa [maq.sourceforge.net]

Benzer paketler:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Etiketler: Alan: Biyoloji, Biyoinformatik, Geliştirildiği dil: implemented-in::c++, implemented-in::perl, Kullanıcı Arayüzü: Komut Satırı, Rol: role::program, scope::utility, Amaç: Ek etiket gerektiriyor, Analiz, use::comparing, use::searching, Desteklenen Biçimler: Ek etiket gerektiriyor, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

maq ile İlgili Diğer Paketler

bağımlılıklar

tavsiye edilen

önerilen

enhances

dep: libc6 (>= 2.29)

GNU C Library: Shared libraries
ayrıca şunun tarafından sağlanan bir sanal paket libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

GCC support library
dep: libstdc++6 (>= 5)

GNU Standard C++ Library v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

compression library - runtime

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

maq indir

Tüm mevcut mimariler için indir
Mimari	Paket Boyutu	Kurulu Boyut	Dosyalar
mipsel	303,5 kB	577,0 kB	[dosya listesi]