Balík: maq (0.7.1-9)

Odkazy pre maq

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík maq:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [maq.sourceforge.net]

Podobné balíky:

maps short fixed-length polymorphic DNA sequence reads to reference sequences

Maq (short for Mapping and Assembly with Quality) builds mapping assemblies from short reads generated by the next-generation sequencing machines. It was particularly designed for Illumina-Solexa 1G Genetic Analyzer, and has a preliminary functionality to handle ABI SOLiD data. Maq is previously known as mapass2.

Developmemt of Maq stopped in 2008. Its successors are BWA and SAMtools.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c++, implemented-in::perl, User Interface: Príkazový riadok, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Need an extra tag, Analyzovanie, use::comparing, use::searching, Supports Format: Need an extra tag, works-with-format::plaintext, works-with::TODO

Ostatné balíky súvisiace s balíkom maq

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.29)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.2)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 5)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

sug: bwa

Burrows-Wheeler Aligner
sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Stiahnuť maq

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
mipsel	303.5 kB	577.0 kB	[zoznam súborov]