Paket: unifrac-tools (1.4-3 och andra)

Länkar för unifrac-tools

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet unifrac-tools:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Andra paket besläktade med unifrac-tools

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libblas3

Basic Linear Algebra Reference implementations, shared library

eller libblas.so.3

virtuellt paket som tillhandahålls av libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.34) [ej alpha, ia64, sh4]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha, amd64, x32]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC stödbibliotek
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) support library
dep: liblapacke (>= 3.12.0)

Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version
dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

Fast LZ compression algorithm library - runtime
dep: libssu0

high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

GNU standardbibliotek v3 för C++
dep: libsz2 (>= 1.1.3)

Adaptive Entropy Coding library - SZIP
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta unifrac-tools

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
alpha (inofficiell anpassning)	1.4-3+b1	1.220,5 kbyte	8.839,0 kbyte	[filförteckning]
amd64	1.4-3+b2	1.630,4 kbyte	7.938,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.4-3+b2	1.407,7 kbyte	8.574,0 kbyte	[filförteckning]
armel	1.4-3+b2	1.488,8 kbyte	9.361,0 kbyte	[filförteckning]
armhf	1.4-3+b2	1.433,5 kbyte	6.258,0 kbyte	[filförteckning]
i386	1.4-3+b2	1.488,4 kbyte	9.868,0 kbyte	[filförteckning]
ia64 (inofficiell anpassning)	1.4-3+b1	1.507,2 kbyte	15.977,0 kbyte	[filförteckning]
m68k (inofficiell anpassning)	1.4-3+b1	1.006,4 kbyte	7.382,0 kbyte	[filförteckning]
mips64el	1.4-3+b2	1.175,9 kbyte	8.790,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.4-3+b2	1.398,9 kbyte	10.110,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.4-3+b2	1.743,7 kbyte	7.082,0 kbyte	[filförteckning]
sh4 (inofficiell anpassning)	1.4-3+b1	1.263,2 kbyte	6.516,0 kbyte	[filförteckning]
x32 (inofficiell anpassning)	1.4-3+b1	1.538,9 kbyte	7.514,0 kbyte	[filförteckning]