Paket: unifrac-tools (1.4-3 und andere)

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Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [github.com]

high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)

The de facto repository for high-performance phylogenetic diversity calculations. The methods in this repository are based on an implementation of the Strided State UniFrac algorithm which is faster, and uses less memory than Fast UniFrac. Strided State UniFrac supports Unweighted UniFrac, Weighted UniFrac, Generalized UniFrac, Variance Adjusted UniFrac and meta UniFrac. This repository also includes Stacked Faith (manuscript in preparation), a method for calculating Faith's PD that is faster and uses less memory than the Fast UniFrac-based reference implementation.

This package contains target binaries ssu and faithpd

Andere Pakete mit Bezug zu unifrac-tools

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libblas3

Grundlegende Unterprogramme für Lineare Algebra, gemeinsame Bibliothek

oder libblas.so.3

virtuelles Paket, bereitgestellt durch libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libc6 (>= 2.38) [nicht alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [nicht ia64]

Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (OpenSSL-Variante)
dep: libgcc-s1 (>= 11) [arm64]

GCC Support-Bibliothek

dep: libgcc-s1 (>= 12) [amd64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64, loong64, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC Support-Bibliothek
dep: libgomp1 (>= 6)

Unterstützungsbibliothek für GCC OpenMP (GOMP)
dep: liblapacke (>= 3.12.0)

Library of linear algebra routines 3 - C lib shared version
dep: liblz4-1 (>= 0.0~r130)

Schnelle Bibliothek für den LZ-Komprimierungsalgorithmus - Laufzeit
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [nicht ia64]

Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken
dep: libssu0

high-performance phylogenetic diversity calculations (lib)
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ia64, m68k]

GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)

dep: libstdc++6 (>= 14) [nicht ia64, m68k]
dep: libsz2 (>= 1.1.3)

Bibliothek zur Codierung mit adaptiver Entropie - SZIP
dep: libunwind8 [ia64]

Bibliothek zur Ermittlung der Aufrufkette eines Programms - Laufzeit
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [ia64]

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

dep: zlib1g (>= 1:1.2.0) [nicht ia64]

unifrac-tools herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.4-3+b2	1.361,5 kB	9.214,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.4-3+b4	1.738,8 kB	8.540,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.4-3+b4	1.506,4 kB	9.077,0 kB	[Liste der Dateien]
armel	1.4-3+b4	1.555,5 kB	9.556,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	1.4-3+b4	1.519,9 kB	6.504,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	1.4-3+b4	1.646,3 kB	10.274,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.4-3+b1	1.507,2 kB	15.977,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.4-3+b3	1.576,1 kB	8.756,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.4-3+b3	1.102,6 kB	7.611,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.4-3+b4	1.347,0 kB	9.510,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.4-3+b4	1.509,5 kB	10.356,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.4-3+b4	1.824,5 kB	7.629,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.4-3+b3	1.390,1 kB	6.952,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.4-3+b3	1.594,5 kB	8.144,0 kB	[Liste der Dateien]