Paket: skewer (0.2.2-6 och andra)

Länkar för skewer

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet skewer:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Andra paket besläktade med skewer

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

GCC stödbibliotek
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU standardbibliotek v3 för C++

Hämta skewer

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
arm64	0.2.2-6+b1	76,4 kbyte	235,0 kbyte	[filförteckning]