Balík: skewer (0.2.2-6 a iné)

Odkazy pre skewer

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík skewer:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

post-processing of high-throughput DNA sequence reads

skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.

Features

 * Detection and removal of adapter sequences
 * Insertion and deletion allowed in pattern matching
 * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads
 * Demultiplexing of barcoded sequencing runs
 * Multi-threading support
 * Trimming based on phred quality scores
 * IUPAC characters for barcodes and adapters
 * Compressed input and output support

Ostatné balíky súvisiace s balíkom skewer

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

podporná knižnica GCC
dep: libstdc++6 (>= 11)

štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť skewer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
arm64	0.2.2-6+b1	76.4 kB	235.0 kB	[zoznam súborov]