Balík: libtfbs-perl (0.7.1+ds-5 a iné)

Odkazy pre libtfbs-perl

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík libtfbs-perl:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [tfbs.genereg.net]

Podobné balíky:

scanning DNA sequence with a position weight matrix

The TFBS perl modules comprise a set of routines to interact with the Transfac and Jaspar databases that describe a special family of proteins, the transcription factors. These bind to genomic DNA to initiate (or prevent) the readout of a gene. Once multiple binding sites are known for a transcription factor, these are gathered in a single file and are aligned in order to find position-specific characteristica that might be used to predict such binding events in novel DNA sequences.

If you use TFBS in your work, please cite "Lenhard B., Wasserman W.W. (2002) TFBS: Computational framework for transcription factor binding site analysis. Bioinformatics 18:1135-1136".

Note: the TFBS perl module is no longer under active development. All the functionality can be found in the TFBSTools Bioconductor package; users are highly encouraged to switch. <http://bioconductor.org/packages/TFBSTools/>

Značky: Software Development: Perl Development, Knižnice, Pole: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implementované v: C, implemented-in::perl, interface::commandline, Role: Vývojová knižnica, Program

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libtfbs-perl

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: bioperl

nástroje jazyka Perl na výpočtovú molekulárnu biológiu
dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, ia64, loong64, sh4]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libdbi-perl

rozhranie k databáze Perl (DBI)
dep: libwww-perl

jednoduché a konzistentné rozhranie k www
dep: pdl (>= 1:2.085-1) [ia64]

perl data language: Perl extensions for numerics

dep: pdl (>= 1:2.100-1) [nie ia64]
dep: pdlapi-20

virtuálny balík poskytovaný balíkom pdl
dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

dep: perl (>= 5.40.1-6) [nie ia64]
dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

virtuálny balík poskytovaný balíkom perl-base
dep: perlapi-5.40.1 [nie ia64]

virtuálny balík poskytovaný balíkom perl-base

rec: libgd-gd2-perl

virtuálny balík poskytovaný balíkom libgd-perl

alebo libgd-gd2-noxpm-perl

virtuálny balík poskytovaný balíkom libgd-perl

Stiahnuť libtfbs-perl

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	219.0 kB	1,029.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	0.7.1+ds-5	219.2 kB	984.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	0.7.1+ds-5	219.4 kB	1,028.0 kB	[zoznam súborov]
armel	0.7.1+ds-5	219.9 kB	1,028.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	0.7.1+ds-5	218.1 kB	1,028.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	219.3 kB	981.0 kB	[zoznam súborov]
i386	0.7.1+ds-5	219.2 kB	980.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	0.7.1+ds-3	218.4 kB	985.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	219.3 kB	1,028.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	218.0 kB	980.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	0.7.1+ds-5	218.9 kB	1,029.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	219.9 kB	1,028.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	0.7.1+ds-5	219.9 kB	1,028.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	0.7.1+ds-5	218.8 kB	976.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	0.7.1+ds-5	218.9 kB	980.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	218.9 kB	1,028.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	218.6 kB	1,990.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	0.7.1+ds-5	218.7 kB	980.0 kB	[zoznam súborov]