[ Zdroj: kissplice ]
Balík: kissplice (2.6.2-2)
Odkazy pre kissplice
Zdroje Debian:
Stiahnuť zdrojový balík kissplice:
Správcovia:
- Debian Med Packaging Team (Stránka QA, Konferencia)
- Andreas Tille (Stránka QA)
- Francois Gindraud (Stránka QA)
Externé zdroje:
- Domovská stránka [kissplice.prabi.fr]
Podobné balíky:
Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data
KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.
Ostatné balíky súvisiace s balíkom kissplice
|
|
|
|
-
- dep: bcalm
- de Bruijn compaction in low memory
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0)
- podporná knižnica GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- štandardná knižnica C++ GNU v3
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- komprimačná knižnica - dynamická verzia
Stiahnuť kissplice
| Architektúra | Veľkosť balíka | Nainštalovaná veľkosť | Súbory |
|---|---|---|---|
| amd64 | 484.5 kB | 1,191.0 kB | [zoznam súborov] |
| arm64 | 472.5 kB | 1,371.0 kB | [zoznam súborov] |
| mips64el | 480.2 kB | 1,467.0 kB | [zoznam súborov] |
| ppc64el | 491.3 kB | 1,435.0 kB | [zoznam súborov] |