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パッケージ: kissplice (2.6.2-2)

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Detection of various kinds of polymorphisms in RNA-seq data

KisSplice is a piece of software that enables the analysis of RNA-seq data with or without a reference genome. It is an exact local transcriptome assembler that allows one to identify SNPs, indels and alternative splicing events. It can deal with an arbitrary number of biological conditions, and will quantify each variant in each condition. It has been tested on Illumina datasets of up to 1G reads. Its memory consumption is around 5Gb for 100M reads.

その他の kissplice 関連パッケージ

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アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 484.5 kB1,191.0 kB [ファイル一覧]
arm64 472.5 kB1,371.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 480.2 kB1,467.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 491.3 kB1,435.0 kB [ファイル一覧]