všetky možnosti
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: ggd-utils  ]

Balík: ggd-utils (1.0.0+ds-1 a iné)

Odkazy pre ggd-utils

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík ggd-utils:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

programs for use in ggd

Takes a genome file and (currently) a .vcf.gz or a .bed.gz and checks that:

    * a .tbi is present
    * the VCF has ""##fileformat=VCF" as the first
    line
    * the VCF has a #CHROM header
    * the chromosome are in the order specified by
    the genome file (and present)
    * the positions are sorted
    * the positions are <= the chromosome lengths
    defined in the genome file.

As a result, any new genome going into GGD will have a .genome file that will dictate the sort order and presence or absence of the 'chr' prefix for chromosomes

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ggd-utils

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť ggd-utils

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 1.0.0+ds-1+b6 1,775.3 kB5,126.0 kB [zoznam súborov]
arm64 1.0.0+ds-1+b6 1,530.8 kB4,842.0 kB [zoznam súborov]
armel 1.0.0+ds-1+b6 1,515.0 kB4,907.0 kB [zoznam súborov]
armhf 1.0.0+ds-1+b6 1,507.8 kB4,883.0 kB [zoznam súborov]
i386 1.0.0+ds-1+b6 1,651.4 kB4,956.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 1.0.0+ds-1+b6 1,379.6 kB5,565.0 kB [zoznam súborov]
mipsel 1.0.0+ds-1+b6 1,412.2 kB5,462.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 1.0.0+ds-1+b6 1,497.5 kB4,905.0 kB [zoznam súborov]
s390x 1.0.0+ds-1+b6 1,619.4 kB5,246.0 kB [zoznam súborov]