Balík: mash (2.3+dfsg-3 a iné)

Odkazy pre mash

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík mash:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [mash.readthedocs.io]

Podobné balíky:

fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

Mash uses MinHash locality-sensitive hashing to reduce large biosequences to a representative sketch and rapidly estimate pairwise distances between genomes or metagenomes. Mash sketch databases effectively delineate known species boundaries, allow construction of approximate phylogenies, and can be searched in seconds using assembled genomes or raw sequencing runs from Illumina, Pacific Biosciences, and Oxford Nanopore. For metagenomics, Mash scales to thousands of samples and can replicate Human Microbiome Project and Global Ocean Survey results in a fraction of the time.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom mash

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.34)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libcapnp-0.9.2

Cap'n Proto C++ library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

podporná knižnica GCC
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) - balík knižnice
dep: libmurmurhash2 (>= 0.2)

Portable MurmurHash Implementation
dep: libstdc++6 (>= 11)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť mash

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	2.3+dfsg-3+b1	183.9 kB	558.0 kB	[zoznam súborov]