Pakiet: mash (2.3+dfsg-3 i inne)

Odnośniki dla mash

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego mash:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [mash.readthedocs.io]

Podobne pakiety:

fast genome and metagenome distance estimation using MinHash

Mash uses MinHash locality-sensitive hashing to reduce large biosequences to a representative sketch and rapidly estimate pairwise distances between genomes or metagenomes. Mash sketch databases effectively delineate known species boundaries, allow construction of approximate phylogenies, and can be searched in seconds using assembled genomes or raw sequencing runs from Illumina, Pacific Biosciences, and Oxford Nanopore. For metagenomics, Mash scales to thousands of samples and can replicate Human Microbiome Project and Global Ocean Survey results in a fraction of the time.

Inne pakiety związane z mash

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libcapnp-0.9.2

Cap'n Proto C++ library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgsl27 (>= 2.7.1)

GNU Scientific Library (GSL) -- library package
dep: libmurmurhash2 (>= 0.2)

Portable MurmurHash Implementation
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie mash

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.3+dfsg-3+b1	183,9 KiB	558,0 KiB	[lista plików]