Пакет: nanopolish (0.14.0-1 и другие) [debports]
Ссылки для nanopolish
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
consensus caller for nanopore sequencing data
Nanopolish uses a signal-level hidden Markov model for consensus calling of nanopore genome sequencing data. It can perform signal-level analysis of Oxford Nanopore sequencing data. Nanopolish can calculate an improved consensus sequence for a draft genome assembly, detect base modifications, call SNPs and indels with respect to a reference genome and more.
Другие пакеты, относящиеся к nanopolish
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhdf5-103-1t64
- HDF5 C runtime files - serial version
-
- dep: libhts3t64 (>= 1.17)
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: libslow5-0 (>= 0.5.1)
- library for reading & writing SLOW5 files
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
-
- dep: libstreamvbyte0 (>= 0.4.1)
- fast integer compression in C using the StreamVByte codec
-
- dep: perl
- практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
-
- dep: python3
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- библиотека сжатия
-
- rec: python3-biopython
- Python3 library for bioinformatics
-
- rec: python3-pysam
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
Загрузка nanopolish
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| x32 (неофициальный перенос) | 0.14.0-1+b1 | 2 144,4 Кб | 9 241,0 Кб | [список файлов] |