Пакет: boxshade (3.3.1-14) [debports]

Ссылки для boxshade

Ресурсы Debian:

Сообщения об ошибках

Исходный код :

Не найден

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.ch.embnet.org]

Подобные пакеты:

создание красивых распечаток множественного выравнивания последовательностей

Boxshade -- это программа для создания "красивых" распечаток множественного выравнивания последовательностей белка или ДНК. Программа не выполняет выравнивание самостоятельно, а требует, чтобы входной файл создавался программой множественного выравнивания или был отредактирован вручную соответствующими инструментами.

Boxshade читает многократно выравненные последовательности из файлов в форматах PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED и ESEE (максимум 150 последовательностей до 10000 элементов каждая). Для выделения идентичных/подобных остатков можно использовать различные вида затенения. Результат выводится на экран или в файл в следующих форматах: ANSI/VT100, PS / EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-принтер, ASCII, xFIG, PICT, HTML

Другие пакеты, относящиеся к boxshade

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.7)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

sug: kalign

Global and progressive multiple sequence alignment

или clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment

или mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences

или hmmer

profile hidden Markov models for protein sequence analysis
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
sug: texlive-latex-extra

TeX Live: LaTeX additional packages
sug: xfig

интерактивное создание рисунков в X11

Загрузка boxshade

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
sparc64 (неофициальный перенос)	50,4 Кб	170,0 Кб	[список файлов]