Paquet : boxshade (3.3.1-14) [debports]
Liens pour boxshade
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IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [www.ch.embnet.org]
Paquets similaires :
Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
Boxshade est conçu pour l'impression de documents de qualité présentant des séquences d'ADN ou des alignements multiples de protéines. Ce n'est pas un programme de calcul d'alignements, il lui faut un fichier en entrée créé par un outil de calcul d'alignement ou édité à la main.
Boxshade lit les alignements de séquences depuis les fichiers générés par les logiciels PILEUP-PSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED et ESEE (dans la limite de 150 séquences contenant au maximum 10 000 éléments chacune). De nombreux jeux d'ombre peuvent être utilisés. La sortie est affichée à l'écran ou peut être envoyée dans un fichier dans les formats suivants : ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML.
Autres paquets associés à boxshade
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- dep: libc6 (>= 2.7)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- sug: kalign
- Alignement séquentiel multiple global et progressif
- ou clustalw
- alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
- ou mafft
- programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
- ou hmmer
- profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
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- sug: seaview
- interface multiplateforme pour l’alignement de séquences et la phylogénie
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- sug: texlive-latex-extra
- TeX Live : paquets LaTeX supplémentaires
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- sug: xfig
- outil de création interactive de dessin sous X11
Télécharger boxshade
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| sparc64 (portage non officiel) | 50,4 ko | 170,0 ko | [liste des fichiers] |