Пакет: libbio-samtools-perl (1.43-5 и другие)

Ссылки для libbio-samtools-perl

Ресурсы Debian:

Исходный код libbio-samtools-perl:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [metacpan.org]

Подобные пакеты:

Perl interface to SamTools library for DNA sequencing

Bio::SamTools provides a Perl interface to the libbam library for indexed and unindexed SAM/BAM sequence alignment databases. It provides support for retrieving information on individual alignments, read pairs, and alignment coverage information across large regions. It also provides callback functionality for calling SNPs and performing other base-by-base functions. Most operations are compatible with the BioPerl Bio::SeqFeatureI interface, allowing BAM files to be used as a backend to the GBrowse genome browser application.

Теги: Разработка программного обеспечения: Разработка на Perl, Библиотеки, Реализовано на: implemented-in::c, implemented-in::perl, Роль: Библиотека разработчика, Динамическая библиотека

Другие пакеты, относящиеся к libbio-samtools-perl

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libbio-perl-perl

BioPerl core perl modules
dep: libc6 (>= 2.15) [sparc64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, loong64, sh4, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: perl (>= 5.22.1-7) [sparc64]

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов

dep: perl (>= 5.38.2-3.2) [ia64]

dep: perl (>= 5.40.0-6) [не hppa, ia64, sparc64]

dep: perl (>= 5.40.1-2) [hppa]
dep: perlapi-5.22.1 [sparc64]

Пакет недоступен
dep: perlapi-5.38.2 [ia64]

виртуальный пакет, предоставляемый perl-base
dep: perlapi-5.40.0 [не hppa, ia64, sparc64]

виртуальный пакет, предоставляемый perl-base
dep: perlapi-5.40.1 [hppa]

виртуальный пакет, предоставляемый perl-base
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

библиотека сжатия

enh: gbrowse

GMOD Generic Genome Browser
enh: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Загрузка libbio-samtools-perl

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.43-5+b1	182,1 Кб	746,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.43-5+b1	177,2 Кб	587,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.43-5+b1	166,2 Кб	615,0 Кб	[список файлов]
armel	1.43-5+b1	162,1 Кб	549,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.43-5+b1	161,3 Кб	449,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.43-5+b2	176,9 Кб	632,0 Кб	[список файлов]
i386	1.43-5+b1	187,4 Кб	621,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.43-5	206,8 Кб	990,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.43-5+b1	170,3 Кб	599,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.43-5+b1	163,0 Кб	541,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.43-5+b1	165,3 Кб	699,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.43-5+b1	182,6 Кб	743,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.43-5+b1	184,7 Кб	743,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.43-5+b1	179,4 Кб	527,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.43-5+b1	171,4 Кб	607,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.43-5+b1	181,0 Кб	614,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.43-1	174,3 Кб	616,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.43-5+b1	177,5 Кб	569,0 Кб	[список файлов]