Пакет: sibelia (3.0.7+dfsg-3)

Ссылки для sibelia

Ресурсы Debian:

Исходный код sibelia:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [bioinf.spbau.ru]

Подобные пакеты:

comparative genomics tool

Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.

Sibelia is useful in finding:

 1) shared regions,
 2) regions that present in one group of genomes but not in others,
 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.

Другие пакеты, относящиеся к sibelia

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: lagan

highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
dep: libc6 (>= 2.4)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)

fast suffix array construction
dep: libgcc-s1 (>= 3.5)

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 9)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

sug: sibelia-examples

comparative genomics tool (example data)

Загрузка sibelia

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
armel	283,4 Кб	1 139,0 Кб	[список файлов]