Пакет: r-bioc-variantannotation (1.48.1-1 и другие) [debports]
Ссылки для r-bioc-variantannotation
Ресурсы Debian:
Исходный код :
Не найденСопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [bioconductor.org]
Подобные пакеты:
BioConductor annotation of genetic variants
This BioConductor package provides R functions to annotate variants, compute amino acid coding changess and to predict coding outcomes.
Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-variantannotation
|
|
|
|
-
- dep: libbz2-1.0
- библиотека сжатия по алгоритму Барроуза—Уилера (динамическая версия)
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb
-
- dep: libcurl4 (>= 7.18.0)
- простая в использовании клиентская библиотека для передачи URL (вариант с OpenSSL)
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- библиотека для работы с архивами в формате XZ
-
- dep: r-api-4.0
- виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.18
- виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)
- GNU R Annotation Database Interface for BioConductor
-
- dep: r-bioc-biobase
- base functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.57.2)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3)
- BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
-
- dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)
- BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers
-
- dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3)
- GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
-
- dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)
- BioConductor representation and manipulation of genomic intervals
-
- dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
-
- dep: r-bioc-matrixgenerics
- S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects
-
- dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)
- HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
-
- dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.0)
- GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import
-
- dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)
- GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks
-
- dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.19.5)
- BioConductor assay container
-
- dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- dep: r-bioc-zlibbioc
- (Virtual) zlibbioc Bioconductor package
-
- dep: r-cran-dbi
- GNU R package providing a generic database interface
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- библиотека сжатия
-
- sug: r-bioc-annotationhub
- GNU R client to access AnnotationHub resources
-
- sug: r-bioc-biocstyle
- standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
-
- sug: r-bioc-snpstats
- BioConductor SnpMatrix and XSnpMatrix classes and methods
-
- sug: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
-
- sug: r-cran-knitr
- GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming
-
- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
Загрузка r-bioc-variantannotation
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 1.48.1-1+b1 | 3 427,5 Кб | 6 251,0 Кб | [список файлов] |