pomiń nawigację

Packages

• About Debian
• Getting Debian
• Support
• Developers' Corner

 / Pakiety / sid (unstable) / gnu-r / r-bioc-variantannotation

[  buster  ] [  bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]

[ Pakiet źródłowy:  ]

Odnośniki dla r-bioc-variantannotation

Zasoby systemu Debian:

• Raporty o błędach

Pobieranie pakietu źródłowego :

Nie znaleziono

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

• Strona internetowa [bioconductor.org]

Podobne pakiety:

• snpeff
• r-bioc-annotationdbi
• r-bioc-annotate
• provean
• r-bioc-snpstats
• r-bioc-go.db
• r-bioc-org.hs.eg.db
• vt-examples
• r-bioc-affy
• vt
• r-bioc-qtlizer

Inne pakiety związane z r-bioc-variantannotation

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

• dep: libbz2-1.0

  Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa

• dep: libc6.1 (>= 2.34)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

• dep: libcurl4 (>= 7.18.0)

  Łatwa w użyciu biblioteka klienta do transferu adresów URL (wersja OpenSSL)

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)

  Biblioteka do kompresji w formacie XZ

• dep: r-api-4.0

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.18

  pakiet wirtualny udostępniany przez r-bioc-biocgenerics

• dep: r-bioc-annotationdbi (>= 1.27.9)

  GNU R Annotation Database Interface for BioConductor

• dep: r-bioc-biobase

  base functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.37.0)

  generic functions for Bioconductor

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.57.2)

  GNU R string objects representing biological sequences

• dep: r-bioc-bsgenome (>= 1.47.3)

  BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages

• dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2)

  BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

• dep: r-bioc-genomicfeatures (>= 1.31.3)

  GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations

• dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.41.5)

  BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

• dep: r-bioc-iranges (>= 2.23.9)

  GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

• dep: r-bioc-matrixgenerics

  S4 Generic Summary Statistic Functions that Operate on Matrix-Like Objects

• dep: r-bioc-rhtslib (>= 1.99.3)

  HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package

• dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.99.0)

  GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

• dep: r-bioc-rtracklayer (>= 1.39.7)

  GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.27.12)

  BioConductor S4 implementation of vectors and lists

• dep: r-bioc-summarizedexperiment (>= 1.19.5)

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-xvector (>= 0.29.2)

  BioConductor representation and manpulation of external sequences

• dep: r-bioc-zlibbioc

  (Virtual) zlibbioc Bioconductor package

• dep: r-cran-dbi

  GNU R package providing a generic database interface

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: r-bioc-annotationhub

  GNU R client to access AnnotationHub resources

• sug: r-bioc-biocstyle

  standard styles for vignettes and other Bioconductor documents

• sug: r-bioc-snpstats

  BioConductor SnpMatrix and XSnpMatrix classes and methods

• sug: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• sug: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• sug: r-cran-runit

  GNU R package providing unit testing framework

Pobieranie r-bioc-variantannotation

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	1.48.1-1+b1	3 427,5 KiB	6 251,0 KiB	[lista plików]