Пакет: python3-cyvcf2 (0.30.4-4)

Ссылки для python3-cyvcf2

Ресурсы Debian:

Исходный код cyvcf2:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Другие пакеты, относящиеся к python3-cyvcf2

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.7) [не amd64, arm64, ppc64el]
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

colored terminal output for Python 3's logging module
dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-numpy-abi9

виртуальный пакет, предоставляемый python3-numpy

Загрузка python3-cyvcf2

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	787,7 Кб	4 755,0 Кб	[список файлов]
arm64	758,6 Кб	4 694,0 Кб	[список файлов]
armel	758,7 Кб	4 662,0 Кб	[список файлов]
armhf	759,8 Кб	4 482,0 Кб	[список файлов]
i386	787,5 Кб	4 779,0 Кб	[список файлов]
mips64el	742,9 Кб	4 773,0 Кб	[список файлов]
mipsel	743,9 Кб	4 724,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	787,2 Кб	4 870,0 Кб	[список файлов]
s390x	751,4 Кб	4 749,0 Кб	[список файлов]