Pakiet: python3-cyvcf2 (0.30.4-4)

Odnośniki dla python3-cyvcf2

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego cyvcf2:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

VCF parser based on htslib (Python 3)

This modules allows fast parsing of VCF and BCF including region-queries with Python. This is essential for efficient analyses of nucleotide variation with Python on high-throughput sequencing data.

cyvcf2 is a cython wrapper around htslib. Attributes like variant.gt_ref_depths return a numpy array directly so they are immediately ready for downstream use.

This package installs the library for Python 3.

Inne pakiety związane z python3-cyvcf2

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]

dep: libc6 (>= 2.7) [armhf, i386]
dep: libhts3 (>= 1.10)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

dep: python3 (<< 3.10)

dep: python3 (>= 3.9~)
dep: python3-click

Wrapper around optparse for command line utilities - Python 3.x
dep: python3-coloredlogs

colored terminal output for Python 3's logging module
dep: python3-numpy (>= 1:1.16.0~rc1)

Fast array facility to the Python 3 language
dep: python3-numpy-abi9

pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

Pobieranie python3-cyvcf2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	787,7 KiB	4 755,0 KiB	[lista plików]
arm64	758,6 KiB	4 694,0 KiB	[lista plików]
armhf	759,8 KiB	4 482,0 KiB	[lista plików]
i386	787,5 KiB	4 779,0 KiB	[lista plików]