Пакет: covtobed (1.2.0+dfsg-1)

Ссылки для covtobed

Ресурсы Debian:

Исходный код covtobed:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

convert the coverage track from a BAM file into a BED file

Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.

Другие пакеты, относящиеся к covtobed

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: bamtools

toolkit for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)

dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.4) [не amd64, arm64, ppc64el]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: zlib1g

библиотека сжатия

Загрузка covtobed

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	44,8 Кб	137,0 Кб	[список файлов]
arm64	39,7 Кб	121,0 Кб	[список файлов]
armel	40,3 Кб	120,0 Кб	[список файлов]
armhf	41,8 Кб	92,0 Кб	[список файлов]
i386	48,5 Кб	144,0 Кб	[список файлов]
mips64el	43,4 Кб	155,0 Кб	[список файлов]
mipsel	43,8 Кб	149,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	45,5 Кб	209,0 Кб	[список файлов]
s390x	40,7 Кб	133,0 Кб	[список файлов]