[ ソース: covtobed ]
パッケージ: covtobed (1.2.0+dfsg-1)
convert the coverage track from a BAM file into a BED file
Reads one (or more) alignment files (sorted BAM) and prints a BED with the coverage. It will join consecutive bases with the same coverage, and can be used to only print a BED file with the regions having a specific coverage range.
その他の covtobed 関連パッケージ
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- dep: bamtools
- BAM（ゲノムアラインメント）ファイルの操作用ツール
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- dep: libbamtools2.5.1 (>= 2.5.1+dfsg)
- dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armhf, i386]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armhf 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: zlib1g
- 圧縮ライブラリ - ランタイム