Package: boxshade (3.3.1-14) [debports]
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Similar packages:
Impressão bonita de múltiplos alinhamentos de sequências
Boxshade é um programa para criar impressões bonitas a partir de multi alinhamentos de proteínas de sequências DNA. O programa não executa o próprio alinhamento e necessita de ler um ficheiro que foi criado por um programa de alinhamentos múltiplos ou editado manualmente com as respectivas ferramentas.
Boxshade lê múltiplos alinhamentos de sequências de ficheiros PILEUP-MSF, CLUSTAL-ALN, MALIGNED-data e ESEE-save (limitado a um máximo de 150 sequências com até 10000 elementos cada). Vários tipos de shading pode ser aplicados a resíduos idênticos/semelhantes. Os resultados são postos no écran ou num ficheiro com os seguintes formatos: ANSI/VT100, PS/EPS, RTF, HPGL, ReGIS, LJ250-printer, ASCII, xFIG, PICT, HTML
Other Packages Related to boxshade
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- dep: libc6.1 (>= 2.7)
- Biblioteca GNU C: Bibliotecas partilhadas
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
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- sug: kalign
- Alinhamento de sequência múltipla global e progressivo
- or clustalw
- global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
- or mafft
- Programa de múltiplos alinhamentos para amino ácidos ou sequências nucleotídeas
- or hmmer
- Modelos Markov de perfil escondido para análises de sequências de proteínas
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- sug: seaview
- Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny
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- sug: texlive-latex-extra
- TeX Live: LaTeX additional packages
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- sug: xfig
- Facility for Interactive Generation of figures under X11
Download boxshade
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 57.3 kB | 185.0 kB | [list of files] |