Package: mafft (7.475-1)

Programa de múltiplos alinhamentos para amino ácidos ou sequências nucleotídeas

MAFFT é um programa de alinhamento de múltiplas sequências que oferece três métodos orientados a precisão:

 * L-INS-i (provavelmente o mais preciso; recomendado para <200

   método de refinação iterativo incorporando informação de alinhamento
   pairwise),
 * G-INS-i (apropriado para sequências de comprimentos semelhantes;
   recomendado para <200 sequências; método de reginação iteractivo
   incorporando informação de alinhamento pairwise),
 * E-INS-i (apropriado para sequências que contếm grandes secções não
   alinháveis, recomendado para <200 sequências),

 * FFT-NS-i ⁽método de refinação iterativo; apenas dois ciclos),
 * FFT-NS-i (método de refinação iterativo; máximo 1000 iterações),
 * FFT-NS-2 (rápido, método progressivo),
 * FFT-NS-1 (muito rápido, recomendado para >2000 sequências; método
   progressivo com uma árvore de guia rude),
 * NW-NS-PartTree-1 (recomendado para ~50,000 sequências; método
   progressivo com o algoritmo PartTree).

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Biological Sequence

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