Package: dialign-tx (1.0.2-14 and others)

Alinhamento de múltiplas sequências baseado em segmentação

DIALIGN-TX é uma ferramenta da linha de comandos para realizar o múltiplo alinhamento de proteínas ou sequências de DNA. É uma completa re-implementação da abordagem da base de segmentação incluindo vários novos melhoramentos e heurísticas que significativamente melhoram a qualidade da produção de alinhamentos, em comparação com DIALIGN 2.2 e DIALIGN-T. Para alinhamento pareado, o DIALIGN-TX usa um algoritmo de fragmentação em cadeia que favorece as cadeias de alinhamentos locais de baixa pontuação sobre os fragmentos isolados de alta pontuação. Para múltiplos alinhamentos, o DIALIGN-TX usa um procedimento melhorado e ganancioso que é menos sensível a semelhanças de sequências locais falsas.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

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