Package: apbs (1.4-1 and others)

Adaptive Poisson Boltzmann Solver (resolvedor adaptativo de Poisson Boltzmann)

O APBS é um pacote de software para a solução numérica da equação de Poisson-Boltzmann (PBE), um dos mais populares modelos contínuos para descrever interações eletrostáticas entre solutos moleculares em meio aquoso iônico ("sal"). Eletrostática contínua representa um papel importante em diversas áreas de simulação biomolecular, incluindo:

 * simulação de processos de difusão para determinar vínculos cinéticos
   ligante-proteína e proteína-proteína,
 * dinâmicas implícitas de solvente molecular de biomoléculas,
 * solvência e cálculos de energia de vinculação para determinar
   constantes de vinculação de equilíbrio ligante-proteína e
   proteína-proteína e auxiliar no projeto de medicamento racional,
 * e estudos de titulação biomolecular.

O APBS foi desenhado para avaliar eficientemente propriedades eletrostáticas para tais simulações para uma ampla gama de tamanhos de escalas para habilitar a investigação de moléculas contendo de dezenas a milhões de átomos.

Tags: Field: Chemistry, Implemented in: C, User Interface: interface::commandline, role::program, Scope: Utility

This page is also available in the following languages (How to set the default document language):