wszystkie opcje
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  forky  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: voronota  ]

Pakiet: voronota (1.29.4415+ds-1 i inne)

Odnośniki dla voronota

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego voronota:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

The analysis of macromolecular structures often requires a comprehensive definition of atomic neighborhoods. Such a definition can be based on the Voronoi diagram of balls, where each ball represents an atom of some van der Waals radius. Voronota is a software tool for finding all the vertices of the Voronoi diagram of balls. Such vertices correspond to the centers of the empty tangent spheres defined by quadruples of balls. Voronota is especially suitable for processing three-dimensional structures of biological macromolecules such as proteins and RNA.

Since version 1.2 Voronota also uses the Voronoi vertices to construct inter-atom contact surfaces and solvent accessible surfaces. Voronota provides tools to query contacts, generate contacts graphics, compare contacts and evaluate quality of protein structural models using contacts.

Inne pakiety związane z voronota

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie voronota

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Wersja Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
alpha (port nieoficjalny) 1.29.4415+ds-1 2 528,7 KiB14 267,0 KiB [lista plików]
amd64 1.29.4415+ds-1 2 623,0 KiB13 568,0 KiB [lista plików]
arm64 1.29.4415+ds-1 2 409,4 KiB12 852,0 KiB [lista plików]
armel 1.29.4415+ds-1 2 280,3 KiB12 530,0 KiB [lista plików]
armhf 1.29.4415+ds-1 2 280,1 KiB11 122,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 1.29.4370+ds-2 2 488,8 KiB12 811,0 KiB [lista plików]
i386 1.29.4415+ds-1 2 633,9 KiB13 553,0 KiB [lista plików]
ia64 (port nieoficjalny) 1.22.3149-2 2 211,0 KiB15 074,0 KiB [lista plików]
loong64 (port nieoficjalny) 1.29.4370+ds-2 2 424,3 KiB12 851,0 KiB [lista plików]
m68k (port nieoficjalny) 1.29.4370+ds-2 2 258,1 KiB13 009,0 KiB [lista plików]
mips64el 1.29.4415+ds-1 2 391,1 KiB14 464,0 KiB [lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny) 1.29.4370+ds-2 2 499,3 KiB14 071,0 KiB [lista plików]
ppc64el 1.29.4415+ds-1 2 586,5 KiB14 004,0 KiB [lista plików]
riscv64 1.29.4370+ds-2 2 486,7 KiB11 825,0 KiB [lista plików]
s390x 1.29.4415+ds-1 2 574,5 KiB13 404,0 KiB [lista plików]
sh4 (port nieoficjalny) 1.29.4370+ds-2 2 713,0 KiB12 529,0 KiB [lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny) 1.29.4415+ds-1 2 268,5 KiB14 265,0 KiB [lista plików]
x32 (port nieoficjalny) 1.29.4415+ds-1 2 652,7 KiB13 270,0 KiB [lista plików]