Paquet : voronota (1.29.4415+ds-1 et autres)

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Ressources externes :

Page d'accueil [www.voronota.com]

Paquets similaires :

Voronoi diagram-based tool to find atom contacts

The analysis of macromolecular structures often requires a comprehensive definition of atomic neighborhoods. Such a definition can be based on the Voronoi diagram of balls, where each ball represents an atom of some van der Waals radius. Voronota is a software tool for finding all the vertices of the Voronoi diagram of balls. Such vertices correspond to the centers of the empty tangent spheres defined by quadruples of balls. Voronota is especially suitable for processing three-dimensional structures of biological macromolecules such as proteins and RNA.

Since version 1.2 Voronota also uses the Voronoi vertices to construct inter-atom contact surfaces and solvent accessible surfaces. Voronota provides tools to query contacts, generate contacts graphics, compare contacts and evaluate quality of protein structural models using contacts.

Autres paquets associés à voronota

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enhances

dep: bsdextrautils

utilitaires supplémentaires de 4.4BSD-Lite
dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [arm64, loong64, ppc64el, s390x]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, amd64, i386, mips64el, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgomp1 (>= 4.9) [non ia64]

bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64]

bibliothèque standard C++ de GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 14) [non ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

Télécharger voronota

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.29.4415+ds-1	2 528,7 ko	14 267,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.29.4415+ds-1	2 623,0 ko	13 568,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.29.4415+ds-1	2 409,4 ko	12 852,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.29.4415+ds-1	2 280,3 ko	12 530,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.29.4415+ds-1	2 280,1 ko	11 122,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.29.4370+ds-2	2 488,8 ko	12 811,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.29.4415+ds-1	2 633,9 ko	13 553,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.22.3149-2	2 211,0 ko	15 074,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.29.4370+ds-2	2 424,3 ko	12 851,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.29.4370+ds-2	2 258,1 ko	13 009,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.29.4415+ds-1	2 391,1 ko	14 464,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.29.4370+ds-2	2 499,3 ko	14 071,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.29.4415+ds-1	2 586,5 ko	14 004,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.29.4370+ds-2	2 486,7 ko	11 825,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.29.4415+ds-1	2 574,5 ko	13 404,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.29.4370+ds-2	2 713,0 ko	12 529,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.29.4415+ds-1	2 268,5 ko	14 265,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.29.4415+ds-1	2 652,7 ko	13 270,0 ko	[liste des fichiers]