Pakiet: snap-aligner (2.0.5+dfsg-1)

Odnośniki dla snap-aligner

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego snap-aligner:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [snap.cs.berkeley.edu]

Podobne pakiety:

Scalable Nucleotide Alignment Program

SNAP is a new sequence aligner that is 3-20x faster and just as accurate as existing tools like BWA-mem, Bowtie2 and Novoalign. It runs on commodity x86 processors, and supports a rich error model that lets it cheaply match reads with more differences from the reference than other tools. This gives SNAP up to 2x lower error rates than existing tools (in some cases) and lets it match larger mutations that they may miss. SNAP also natively reads BAM, FASTQ, or gzipped FASTQ, and natively writes SAM or BAM, with built-in sorting, duplicate marking, and BAM indexing.

Inne pakiety związane z snap-aligner

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [nie alpha, loong64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [nie riscv64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie snap-aligner

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	823,4 KiB	2 339,0 KiB	[lista plików]
amd64	837,3 KiB	2 215,0 KiB	[lista plików]
arm64	800,0 KiB	2 079,0 KiB	[lista plików]
loong64 (port nieoficjalny)	813,7 KiB	2 079,0 KiB	[lista plików]
mips64el	821,9 KiB	2 545,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	845,4 KiB	2 463,0 KiB	[lista plików]
riscv64	832,0 KiB	1 783,0 KiB	[lista plików]