Paquet : snap-aligner (2.0.5+dfsg-1)

Liens pour snap-aligner

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Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [snap.cs.berkeley.edu]

Paquets similaires :

Scalable Nucleotide Alignment Program

SNAP is a new sequence aligner that is 3-20x faster and just as accurate as existing tools like BWA-mem, Bowtie2 and Novoalign. It runs on commodity x86 processors, and supports a rich error model that lets it cheaply match reads with more differences from the reference than other tools. This gives SNAP up to 2x lower error rates than existing tools (in some cases) and lets it match larger mutations that they may miss. SNAP also natively reads BAM, FASTQ, or gzipped FASTQ, and natively writes SAM or BAM, with built-in sorting, duplicate marking, and BAM indexing.

Autres paquets associés à snap-aligner

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, loong64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 4.0) [non riscv64]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.3) [riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.4)

Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger snap-aligner

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	823,4 ko	2 339,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	837,3 ko	2 215,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	800,0 ko	2 079,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	813,7 ko	2 079,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	821,9 ko	2 545,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	845,4 ko	2 463,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	832,0 ko	1 783,0 ko	[liste des fichiers]