wszystkie opcje
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  forky  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: jellyfish  ]

Pakiet: libjellyfish-2.0-dev (2.3.1-4 i inne)

Odnośniki dla libjellyfish-2.0-dev

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego jellyfish:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

count k-mers in DNA sequences (development files of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the development files (static library and header files)

Znaczniki: Rozwój oprogramowania: Biblioteki, Rola: Biblioteka deweloperska

Inne pakiety związane z libjellyfish-2.0-dev

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie libjellyfish-2.0-dev

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Wersja Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 2.3.1-4+b1 135,2 KiB691,0 KiB [lista plików]
arm64 2.3.1-4+b1 132,6 KiB687,0 KiB [lista plików]
hppa (port nieoficjalny) 2.3.1-2+b1 134,3 KiB627,0 KiB [lista plików]
ia64 (port nieoficjalny) 2.3.0-12 150,5 KiB825,0 KiB [lista plików]
loong64 (port nieoficjalny) 2.3.1-4+b1 325,3 KiB3 200,0 KiB [lista plików]
mips64el 2.3.1-4+b1 140,2 KiB767,0 KiB [lista plików]
ppc64el 2.3.1-4+b1 140,6 KiB718,0 KiB [lista plików]
riscv64 2.3.1-4+b1 268,7 KiB2 294,0 KiB [lista plików]