Pakiet: libjellyfish-2.0-2 (2.3.1-3 i inne)

Odnośniki dla libjellyfish-2.0-2

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego jellyfish:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.genome.umd.edu]

Podobne pakiety:

count k-mers in DNA sequences (dynamic library of jellyfish)

JELLYFISH is a tool for fast, memory-efficient counting of k-mers in DNA. A k-mer is a substring of length k, and counting the occurrences of all such substrings is a central step in many analyses of DNA sequence. JELLYFISH can count k-mers using an order of magnitude less memory and an order of magnitude faster than other k-mer counting packages by using an efficient encoding of a hash table and by exploiting the "compare-and-swap" CPU instruction to increase parallelism.

JELLYFISH is a command-line program that reads FASTA and multi-FASTA files containing DNA sequences. It outputs its k-mer counts in an binary format, which can be translated into a human-readable text format using the "jellyfish dump" command.

This package contains the dynamic library the main executable of jellyfish is linked to.

Znaczniki: Rola: Biblioteka współdzielona

Inne pakiety związane z libjellyfish-2.0-2

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [nie ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libc6.1 (>= 2.31) [ia64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie hppa, ia64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie ia64]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 9) [ia64]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe

Pobieranie libjellyfish-2.0-2

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	2.3.1-3+b4	65,6 KiB	205,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.3.1-3+b4	60,6 KiB	220,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.3.1-2+b1	66,9 KiB	208,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.3.0-12	75,2 KiB	315,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.3.1-3+b4	60,7 KiB	233,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.3.1-3+b4	69,6 KiB	285,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.3.1-3+b4	65,0 KiB	172,0 KiB	[lista plików]