Pakiet: bedtools (2.31.1+dfsg-2 i inne)

Odnośniki dla bedtools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego bedtools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

suite of utilities for comparing genomic features

The BEDTools utilities allow one to address common genomics tasks such as finding feature overlaps and computing coverage. The utilities are largely based on four widely-used file formats: BED, GFF/GTF, VCF, and SAM/BAM. Using BEDTools, one can develop sophisticated pipelines that answer complicated research questions by streaming several BEDTools together.

The groupBy utility is distributed in the filo package.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c++, interface::commandline, Rola: Program, Zakres: Zestaw, Przeznaczenie: use::analysing, use::comparing, Konwersja danych, use::filtering, works-with::biological-sequence

Inne pakiety związane z bedtools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libbz2-1.0 [nie sparc64]

Wysokiej jakości biblioteka kompresji plików - wersja uruchomieniowa
dep: libc6 (>= 2.23) [sparc64]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.34) [nie alpha, ia64, sh4, sparc64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, s390x, x32]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

Biblioteka wspomagająca GCC
dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sparc64]

Pakiet niedostępny
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614) [nie sparc64]

Biblioteka do kompresji w formacie XZ
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie sparc64]

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

Biblioteka do ustalania łańcucha wywołań programu - środowisko uruchomieniowe
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie sparc64]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [sparc64]

Pobieranie bedtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
alpha (port nieoficjalny)	2.31.1+dfsg-2	608,1 KiB	2 458,0 KiB	[lista plików]
amd64	2.31.1+dfsg-2	661,8 KiB	2 106,0 KiB	[lista plików]
arm64	2.31.1+dfsg-2	574,4 KiB	2 006,0 KiB	[lista plików]
armel	2.31.1+dfsg-2	547,2 KiB	1 817,0 KiB	[lista plików]
armhf	2.31.1+dfsg-2	564,5 KiB	1 313,0 KiB	[lista plików]
hppa (port nieoficjalny)	2.31.1+dfsg-2	621,0 KiB	1 976,0 KiB	[lista plików]
i386	2.31.1+dfsg-2	727,9 KiB	2 301,0 KiB	[lista plików]
ia64 (port nieoficjalny)	2.31.1+dfsg-2	796,8 KiB	4 272,0 KiB	[lista plików]
m68k (port nieoficjalny)	2.31.1+dfsg-2	623,5 KiB	2 045,0 KiB	[lista plików]
mips64el	2.31.1+dfsg-2	582,9 KiB	2 599,0 KiB	[lista plików]
ppc64 (port nieoficjalny)	2.31.1+dfsg-2	658,7 KiB	2 710,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	2.31.1+dfsg-2	664,1 KiB	2 518,0 KiB	[lista plików]
riscv64	2.31.1+dfsg-2+b2	644,0 KiB	1 603,0 KiB	[lista plików]
s390x	2.31.1+dfsg-2	646,6 KiB	2 162,0 KiB	[lista plików]
sh4 (port nieoficjalny)	2.31.1+dfsg-2	752,8 KiB	1 942,0 KiB	[lista plików]
sparc64 (port nieoficjalny)	2.26.0+dfsg-5	460,9 KiB	1 898,0 KiB	[lista plików]
x32 (port nieoficjalny)	2.31.1+dfsg-2	665,9 KiB	2 001,0 KiB	[lista plików]