Pakiet: maffilter (1.3.1+dfsg-4)

Odnośniki dla maffilter

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego maffilter:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [jydu.github.io]

Podobne pakiety:

process genome alignment in the Multiple Alignment Format

MafFilter applies a series of "filters" to a MAF file, in order to clean it, extract data and computer statistics while keeping track of the associated meta-data such as genome coordinates and quality scores.

 * It can process the alignment to remove low-quality / ambiguous /
   masked regions.
 * It can export data into a single or multiple alignment file in
   format such as Fasta or Clustal.
 * It can read annotation data in GFF or GTF format, and extract the
   corresponding alignment.
 * It can perform sliding windows calculations.
 * It can reconstruct phylogeny/genealogy along the genome alignment.
 * It can compute population genetics statistics, such as site
   frequency spectrum, number of fixed/polymorphic sites, etc.

Inne pakiety związane z maffilter

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Biblioteka Boost.Iostreams
dep: libbpp-core4 (>= 2.4.1)

Bio++ Core library
dep: libbpp-phyl-omics3 (>= 2.4.1)

Bio++ Phylogenetics library: genomics components
dep: libbpp-phyl12 (>= 2.4.1)

Bio++ Phylogenetic library
dep: libbpp-seq-omics3 (>= 2.4.1)

Bio++ Sequence library: genomics components
dep: libbpp-seq12 (>= 2.4.1)

Bio++ Sequence library
dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libstdc++6 (>= 11)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3

sug: maffilter-examples

process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)

Pobieranie maffilter

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	254,0 KiB	1 312,0 KiB	[lista plików]
arm64	233,3 KiB	1 304,0 KiB	[lista plików]
armel	215,3 KiB	1 175,0 KiB	[lista plików]
armhf	221,0 KiB	1 047,0 KiB	[lista plików]
i386	260,8 KiB	1 291,0 KiB	[lista plików]
mips64el	219,1 KiB	1 488,0 KiB	[lista plików]
mipsel	220,3 KiB	1 413,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	252,9 KiB	1 432,0 KiB	[lista plików]
s390x	231,5 KiB	1 324,0 KiB	[lista plików]