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パッケージ: gromacs-mpi (2021.4-2) [debports]
gromacs-mpi に関するリンク
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外部の資源:
- ホームページ [www.gromacs.org]
類似のパッケージ:
Molecular dynamics sim, binaries for MPI parallelization
GROMACS is a versatile package to perform molecular dynamics, i.e. simulate the Newtonian equations of motion for systems with hundreds to millions of particles.
It is primarily designed for biochemical molecules like proteins and lipids that have a lot of complicated bonded interactions, but since GROMACS is extremely fast at calculating the nonbonded interactions (that usually dominate simulations) many groups are also using it for research on non- biological systems, e.g. polymers.
This package contains only the core simulation engine with parallel support using the default MPI interface on the chosen architecture. It is suitable for nodes of a processing cluster, or for multiprocessor machines.
その他の gromacs-mpi 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.32)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libfftw3-double3 (>= 3.3.5)
- 高速フーリエ変換計算ライブラリ - 倍精度
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- dep: libfftw3-single3 (>= 3.3.5)
- 高速フーリエ変換計算ライブラリ - 単精度
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [sh4]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
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- dep: libhwloc15 (>= 2.6.0)
- マシンの階層的ビュー - 共有ライブラリ
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- dep: libopenmpi3 (>= 4.1.2~rc1)
- high performance message passing library -- shared library
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: mpi-default-bin
- Standard MPI runtime programs (metapackage)
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- dep: sse4.2-support [x32]
- CPU feature checking - require SSE4.2
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
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- rec: gromacs
- Molecular dynamics simulator, with building and analysis tools
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- sug: gromacs-data
- GROMACS molecular dynamics sim, data and documentation